Gonzalo Guillén comenzó su trayectoria en Acesur en 1989 como asistente del departamento de Exportación. Estar en contacto directo con la realidad del sector le sirvió para ascender paulatinamente hasta convertirse en director internacional de la empresa en 1992, cargo que ocupó durante diez años.
Desde 2002 desempeña el puesto de director general en Acesur, que ha compaginado, entre otras responsabilidades, con la presidencia de la Asociación Nacional de Envasadores e Industriales Aceites Comestibles (Anierac), la vicepresidencia de la Asociación Española de Exportadores de Aceites de Oliva (Asoliva), la vicepresidencia de la FIAB (Federación de industrias y bebidas de España), o la vicepresidencia de la patronal europea de alimentos y bebidas Food and Drink.